冷冻干燥机操作方法：冷冻干燥前，先将准备干燥的物品置于低温冰箱，使物品完全冰冻结实，方可进行冷冻干燥。主机与真空泵之间由真空管连接，连接处采用卡箍。卡箍内含一只密封橡胶圈，连接前可在橡胶圈上涂抹适量真空脂，再用卡箍卡紧。
主机的右侧板上设有真空泵的电源插座，将真空泵的电源线连接好。检查真空泵，确认已加注真空泵油，不可无油运转。油面不得低于油镜中线。主机冷阱上方的“O”型密封橡胶圈应保持清洁，次使用时，可薄薄涂上一层真空脂，有机玻璃罩置于橡胶圈上，轻轻旋转几下，有利于密封。
开机操作：
1.接通电源线，此时察看总电源指示灯是否闪烁，闪烁说明电源已接通。按下“总电源”开关键三秒，此时“冷阱温度”显示窗开始显示冷阱温度，放开此键。
2.按下“真空泵”开关键，真空泵开始工作，数码显示下降直至20Pa以下，冷冻干燥进程开始。在真空泵开始工作时，用力下压有机玻璃罩片刻，有利于密封。
3.按下“制冷机”开关键，制冷机开始运转，冷阱温度逐渐降低。为使冷阱具有充分吸附水份的能力，预冷时间应不少于30分钟。按下“真空计”开关键，此时真空数码显示为“110”，“103”指示灯亮。
4.多歧管型首先应将橡胶阀关闭，待真空度达到20Pa以下时将预冻结束的冻干瓶插入橡胶阀下接口，将塑料阀芯向下旋转180度。注意：此时真空计示数会有回升，应在真空度达到20Pa以下时，再装下一瓶。
5.预冷结束后，将已准备好的待干燥物品置于干燥盘中，罩上有机玻璃筒，将充气阀和放水阀，顺时针方向拧紧。
