目前上海已无上海医科大学这个名称了。
文化大革命运动结束前，上海的医科院校有上海第一医学院，上海第二医学院，上海中医学院等医科院校，它们的性质都是公立院校。
上世纪八十年代，这些院校的命名纷纷升格，分别命名为上海医科大学（为便于区别，俗称一医大），上海第二医科大学，上海中医药大学，它们的性质未变，仍是公立。
再后来全国院校合并调整，上海医科并入复旦大学，命名为复旦大学医学院，故上海医科大学这个名称已没有了。
1985年复旦大学上海医学院曾经被取名为上海医科大学。现在是全国有名的国立医药大学复旦大学上海医学院始建于1927年，原为国立中央大学医学院，是中国创办的第一所国立大学医学院。1932年，国立中央大学医学院独立为国立上海医学院，为当时中国唯一的国立医学院。1939年，抗战爆发后，学院内迁至云南昆明；1940年辗转迁至四川重庆。抗战胜利，学院迁回上海，于1952年更名为上海第一医学院。1985年，上海第一医学院定名为上海医科大学。学院于1959年被定为全国16所重点高等学府之一，并于1997年入选首批211工程。2000年，上海医科大学和复旦大学合并办学，组建成为新的复旦大学。2011年，新的上海医学院成立，作为复旦大学党政的派出机构，根据学校的授权，在大医口的人才培养、科学研究、学科建设、发展规划、资源配置、对外交流等方面，行使相对独立的管理权限。
