阿富汗历史的文字记载可以追溯至约公元前500年的阿契美尼德王朝，而考古证据显示公元前3000年至2000年间已有城镇文化出现。亚历山大大帝及其马其顿军队在公元前330年征服波斯帝国后，征服了阿富汗。
阿富汗曾是不少强大帝国的首都所在地，包括大夏、贵霜帝国、贵霜-萨珊王朝、喀布尔-夏希王朝、萨法尔王朝、萨曼王朝、伽色尼王国、古尔王朝、卡尔提德王朝、帖木儿帝国、蒙兀儿帝国、汉达基王朝和杜兰尼王朝。阿富汗位于许多移民和贸易路线上，因此被称为“中亚绕道”，那些路线从两河流域经伊朗高原，从印度河流域通过兴都库什山脉，从远东到塔里木盆地和从毗邻的欧亚草原。
中亚人被认为是从公元前20世纪抵达阿富汗，放弃原本的语言并组成新的普什图语和达利语。中东地区影响了阿富汗文化，印度教、祆教、马其顿和佛教都在阿富汗消失了。有为的统治者使中世纪的阿富汗不但是一个军事强国，还是一个文化强国，产生许多著名学者如伊本·西那和比鲁尼等标志性人物。
在18世纪初，艾哈迈德沙·杜兰尼效法米尔维斯·霍塔克，统一了阿富汗各部落并建立最后一个杜兰尼王朝。阿富汗在三次英阿战争中三次获胜，保持阿富汗的独立。1979年苏联入侵阿富汗，企图组织一个亲苏政府的阿富汗，但各派系的反抗使苏军大受打击而撤出。
2001年911事件爆发，美国发动的阿富汗战争使阿富汗从塔利班的统治下解放，计划铲除恐怖组织并重建阿富汗为一个现代国家，然而阿富汗仍然贫困且为毒品大国，在山区与美军持续进行游击战，美军主力因不堪压力而撤军，但恐怖组织威胁下，至今仍需要驻留部分美军驻在阿富汗以维持治安，反恐战争冲突并未有得到解决。总观近代以来，英美苏各国列强多次入侵均告失败，因此阿富汗被称为“帝国坟场”。
