清朝的总督和提督的差别很大，从地位上来说，总督是封疆大吏，是一省或数省的军政最高长官，而提督只是军官，是一省的绿营兵的军事主官，他是只是一个省的军事主官，即负责带兵打仗的，但不是军队的统帅，军队的统帅是总督。提督是带兵官，不是统兵官。
清代的定制，总督为文官从一品，并按惯例有“兵部尚书兼右都御史”的加衔，因此总督的职权是“掌治军民，综制文武”。所以说总督是一省或数省的军政最高长官。
提督在清代的定制，是武官的从一品，从品级上看跟总督好像差不多，但文官之间，差别就大了，因为武将做到提督就到头了，提督就是武将的天花板了。所以在官场，提督的地位那怕跟总督的品级一样，也要矮人一截。因为提督中介类似于专业技术人员，不是真正意义上的“官”。提督的职权是“掌巩护疆陲，典领甲卒，节制鎭、协、营、汛，课第殿最，以听于总督”，提督实际上就是带着兵听总督的命令做事的，简单地说，提督虽然有兵，但无兵权，兵权在总督手上。
我们举个例子来理解一下。鸦片战争中，定海失守之后，朝廷对于收复定海的安排是廷寄谕旨给闽浙总督邓廷桢，原话是：
着邓廷桢选派闽省大员，带领舟师，星飞赴浙，无论夷船在于何处，卽会同浙江水师合兵会剿等因。钦此。
可以清楚地看到，地方军务的负责人是总督不是提督，中央对地方军事问题的决策是由总督去负责执行。邓廷桢接到朝廷的谕旨后，先是将本省兵马集结，然后又命人去招募士兵组建援浙军，可以说执行朝廷的军事决策的是总督，那么这时的提督余步云是在干什么呢？
余步云对于援浙军事，基本上没权过问，只是等到福建方面的军队集结完毕后，邓廷桢下令让福建提督余步云带兵前去浙江增援，这时余步去才有事可做，朝廷的谕旨中让邓廷桢“选派闽省大员”去浙江增援，而邓廷桢选派就是提督余步云，所以决定提督带什么兵去哪里打仗，是由总督决定的。同时因为余步云带兵赴浙，邓廷桢在征求了余步云的意见后，委任建宁总兵曾大观出任代理提督之职。可见总督不但有权指挥提督，还对提督的职务也有人事任免权。
上面这个例子中，余步云身为提督，是武将，所以要负责去带兵打仗，但是他没有兵权，无权决定到那里去打仗，以及打什么兵去打仗，这些事情都是由总督根据朝廷的旨意来决定的，同时总督虽然有兵权，但他们不能直接去带兵，因为总督是文官，没有能力亲自上战场上去指挥士兵作战的。
