1、材质不同。沉香是木材在多油脂的情况下，经过数年的沉积而形成。而檀香仅仅是檀香树的心材而已。
2、珍稀度不同。檀香比较常见，如：紫檀、黄檀、黑檀、绿檀等等。而沉香就较为稀有。世界主要沉香产国是越南，沉香在越南被奉为国宝。其最著名的就是奇楠。
一、沉香与檀香本质上的区别，沉香是香脂，而檀香是香木。沉香是在沉香树病变或外力伤害后，自愈的疤结，结合油脂和木质，根据沉香结香的程度，沉香油脂会多于木质成分的情况。檀香在树木成年后，分泌带有香气的脂液，整个树木都会带有这种香气，是一种香木。
二、沉香与檀香香味上的区别，沉香自然状态下香韵味道小，一些产地的沉香生闻味道很淡，经过熏烧后会散发香味。檀香味道浓郁，自然状态挥发出大量香韵。
三、沉香与檀香树种上的区别，沉香是瑞香科树种活着的时候病变或外力伤害后，经过真菌结出来的油脂，严格意义上讲，沉香并不是树，而使树的衍生。檀香是直接取自檀香树木的芯材。
四、沉香与檀香珍贵上的区别，沉香归位沉檀龙麝之首，百香之首，资源稀缺，形成过程复杂，比较珍贵。檀香比较常见，有黄檀，小叶紫檀，红檀，黑檀，绿檀。
五、沉香与檀香价格上的区别，沉香好比海南黄花梨，而檀香好比越南黄花梨。自然沉香价格高，近几年沉香价格水涨船高，相比之下的檀香，价格要比沉香低一些。
六、沉香与檀香使用上的区别，沉香与檀香的区别，是暗香与明香的分别。沉香香韵优雅清淡，醇厚绵长，在身体疲惫时，在沉香暗香中可以得到缓解，安神助气，久闻无害。檀香香味浓郁，带有异域风情，在香味下人的精神得到提振，但不可久闻，久闻有泄气之害，对身体无益。
