物理处理法：利用物理原理和方法，分离豆腐加工废水中的污染物，在处理过程中一般不改变水的化学性质。物理处理法包括筛滤法、沉淀法、浮上法、过滤法和膜处理法等。
化学及物理化学处理法：利用化学反应的原理和方法，分离豆腐加工废水的污染物，使其转化为无害或可再生利用的物质。化学及物理化学处理法包括中和、混凝、氧化还原、萃取、吸附、离子交换、电渗析等，这些处理方法更多地用于食品废水处理的深度处理。
生物法：利用微生物的新陈代谢功能使豆腐加工废水中呈溶解和胶体状态的有机污染物被降解并转化为无害物质。按微生物对氧的需求，生物处理法可分为好氧处理法和厌氧处理法两类。按微生物存在的形式，可分为活性污泥法、生物膜法等类型。豆制品废水COD 含量高、有机物含量高，在漂洗阶段产生的废水中还含有大量悬浮物质，如豆渣、砂土等以及蛋白质、糖类、脂类物质，与一般食品废水一样几乎不含有毒有害物质，水中营养物质充足，可生化性好，在现有的豆腐加工废水处理工程中多采用生物处理法进行处理。
在制作豆腐过程中，可以对豆腐的剩余水进行以下处理：
1. 做豆腐乳：豆腐的剩余水可以用来制作豆腐乳。将豆腐水煮沸，加入适量的食盐、白酒、五香粉等调味料，搅拌均匀后放凉，倒入干净的容器中，盖好盖子，放置数天至数周发酵成豆腐乳。
2. 做汤或煮饭：将豆腐水作为汤的基础，加入蔬菜、肉类或其他配料，煮成美味的汤。或者将豆腐水用来代替普通的清水煮饭，给米饭增加一些豆腐的香味。
3. 浇花或施肥：将豆腐水用于浇花或植物的施肥。豆腐水中含有一定的养分，可以作为植物的一种肥料，提供一些额外的营养。
