杜本是一种树木的名，也称甘棠，即杜梨，属古代的陕西长安地区生长一种杜梨枝，是神农氏中一支氏族所擅长栽培的树，已经成为该氏族的社树，即神树。
这支氏族崇拜杜梨树为氏族的原始图腾，以杜命氏族名，以杜命居地名，建立国家后称杜城，最终形成国和姓，这应该是杜姓最早的起源。
姓氏来源
源于祁姓，出自帝尧裔孙刘累之后裔的封地，属于以国名为氏。
黄帝的二十五子之一有个叫祁的，尧姓伊祁，杜氏源于祁姓，是帝尧的后代。尧除承继祖辈姬姓外，又因其母庆都(居于今河南淮阳的有锋氏族部落之女)在祁地伊长孺家生下他，故又以地名“祁”为姓。
源于芈姓，出自春秋时期楚国君主杜敖，属于以先祖名字为氏。
春秋时期，楚国有君主名叫熊艰，号称杜敖，亦称堵敖、庄敖。
据史籍《史记·楚世家》中记载：“武王卒师中而兵罢。子文王熊赀立，始都郢。文王二年，伐申，过邓，邓人曰‘楚王易取’，邓侯不许也。六年，伐蔡，虏蔡哀侯以归，已而释之。楚强，陵江汉间小国，小国皆畏之。十一年，齐桓公始覇，楚亦始大。十二年，伐邓，灭之。十三年卒。子囏立，是为杜敖。杜敖五年，欲杀其弟熊恽，恽奔随，与随袭弑杜敖，代立。”在楚杜敖熊艰被弑后，其族人后裔分散避难，有以先王称号为姓氏者，称杜氏、或称堵氏，后统称为杜氏，世代相传至今。
源于姬姓，出自黄帝时期的酿酒发明者杜康，属于以先祖名字为氏。
据史籍《世本》记载，杜氏是黄帝时期的酿酒发明人杜康的后代。相传，杜康原是黄帝手下的一位大臣。
黄帝建立部落联盟后，经过神农氏尝百草，辨五谷，开始耕地种粮食。黄帝命杜康管理生产粮食，杜康很负责任。另外一种传说是：杜康又名少康，夏王朝时期人，是中国历史上第一个奴隶制国家夏朝的第五位国王。
源于其他少数民族改姓
鲜卑族，蒙古族，女真族，满族等少数民族改姓而来。
