1、代表含义不同：
（1）申论，国家机关，公务员录用考试中，考生根据指定的材料进行分析，提出见解，并加以论证。申论考试是具有模拟公务员日常工作性质的能力考试。
（2）议论文，又叫说理文，是一种剖析事物论述事理，发表意见，提出主张的文体。作者通过摆事实，讲道理，辨是非等方法，来确定其观点正确或错误，树立或否定某种主张。议论文应该观点明确，论据充分，语言精炼，论证合理，有严密的逻辑性。
2、目的不同：
（1）申论主要考查应考人员对给定材料的分析，概括，提炼，加工，测查应考人员的阅读理解能力，综合分析能力，提出问题和解决问题能力，贯彻执行能力，文字表达能力等。
作为一种选拔人才的测试方式，申论的命题非常准确，科学，它是在充分吸收策论，基础写作和公文写作优点的基础上，发展起来的一种以考查学生的实际能力为目标的科学的测评方式。
（2）议论文是以议论为主要表达方式，通过摆事实，讲道理，直接表达作者的观点和主张的常用文体。它不同于记叙文以形象生动的记叙来间接地表达作者的思想感情，也不同于说明文侧重介绍或解释事物的形状，性质，成因，功能等。总而言之，议论文是以理服人的文章，记叙文和说明文则是以事感人，以知授人的文章。
