据《泉州志》记载,唐代时这里桑园园主黄守恭有一天梦见一位和尚让他舍地建寺,不便拒绝,于是提了一个条件:如果园中的桑树在三天内能开出白莲花,就施舍。不料三天内桑树真的开出了白莲花,黄守恭也就依照约定舍地为寺,故此得名“莲花寺”。至今寺内西面还有一株古桑树,年代久远,开元寺也因此又被称为“桑莲法界”。
开元寺布局严谨,建筑宏伟,主要建筑有天王殿、大雄宝殿、戒坛、藏经阁、水陆寺、檀越祠、准提禅林。
开元寺之所以闻名遐迩,主要是因为寺院的两侧广场,分别就是著名的两座古石塔,东为镇国塔,西为仁寿塔,合称“紫云塔”,被称为石塔中的“塔中奇珍”。两塔傲然卓立,巍然对峙,相距约200米,使整个寺院的布局显得更加的宏敞壮观,塔高40多米,是中国现存最高的石塔。