花剌子模在公元前6世纪为波斯帝国的一个省。公元前4世纪初独立,后受印度的贵霜帝国控制。3世纪时,波斯萨珊王朝重新控制花剌子模。7世纪末前后为阿拉伯人征服。11世纪到13世纪受塞尔柱突厥统治,领土包括波斯的东部和阿富汗。1219年被成吉思汗的蒙古帝国征服。1388年又为帖木儿征服,后又归波斯统治。
16世纪初,花剌子模南部地区出现了独立的布哈拉汗国。1512年,花剌子模绿洲居民起义,摆脱波斯统治,拥立乌兹别克汗国王族成员为汗,建立独立的国家,即希瓦汗国。1873年被沙俄吞并。1920年建立花剌子模苏维埃人民共和国,1924年解散,其领土并入乌兹别克和土库曼两个加盟共和国。