结局是云龙被人民政府处决。
结局中,云龙被带回了公安局监狱,云飞不但给云龙大烟抽,还和云龙铐在一起,为他疗伤,云龙向云飞认罪,得知云飞一直念着同门之情并不怪罪于他。
云龙伤愈,云飞要对云龙进行最后的审讯,在审讯过程中,云龙得知共产党已经查清师傅并非自己所杀,还了自己的清白,云龙决定认罪画押。得知在公审大会后将被枪决时云龙后悔莫及。
出于同门之谊,李云馨来到监狱看望云龙,云龙向云馨吐露真情,说这辈子爱过的女人只有师姐云馨一个。云馨见云龙对自己犯下的罪行真心忏悔,便去求云飞宽恕云龙,但云飞说,现在云龙已经罪大恶极,没有人能救得了他了。
云龙被人民政府处决,结束了其亦正亦邪的一生。他的坟前,云飞与云馨相对无言。重新回到书场的铁嘴霸王说起了新燕子李三的故事,由衷地感慨道:人民政府威力大,得民心者得天下。