发酵饲料的优点：
1、可抑制饲料中有毒有害物质，如豆粕中含有的大豆抗原蛋白、胰蛋白抑制因子、植物凝集素、脲酶等抗营养因子，通过微生物发酵能改善其营养物质的消化吸收，减少腹泻的发生，提高动物健康。用枯草芽孢杆菌和米曲霉菌发酵后的豆粕，豆粕中大分子物质从40%降低到2%和8%，胰蛋白酶抑制因子分别减少了96%和82%，仅用枯草芽孢杆菌发酵大豆粕，也得出了类似的结论，发酵豆粕中的胰蛋白酶抑制因子显著下降，大豆的营养价值也有所提高。此外，通过微生物发酵后，能降低或是消除棉籽粕中含有的棉酚、环丙烯脂肪酸、植酸及植酸盐、非淀粉多糖等抗营养因子，增加采食量、维护动物健康、降低饲料中的有害物质、提高动物机体免疫力。
2、发酵还可以利用一些杂粮、杂粕和农副产品的下脚料等非常规饲料进行发酵，这不仅能降低饲料的成本，还可以增加产品的收益。用酵母菌发酵的木薯片蛋白浓缩饲料代替豆粕，提高了瘤胃发酵效率、肠道微生物蛋白合成率和营养物质消化率，并降低饲料成本。
3、厌氧发酵饲料，可以使饲料中的纤维物质软化，且芽孢杆菌、酵母菌等好氧微生物的存在为乳酸的厌氧发酵提供了良好的条件，使乳酸菌产生大量的乳酸，降低饲料的pH，使得发酵饲料产生特有的酸香味，改善适口性，提高动物采食量。利用乳酸菌对饲料进行发酵时，在发酵期间可以产生酸性物质可杀灭和抑制杂菌的生长，产生浓郁的酸香味，对于改善动物产品风味和饲料的适口性具有良好的效果。
发酵饲料的缺点：
1、仅适合自配料客户使用，若是直接饲喂全价颗粒料，没办法使用发酵饲料。
2、最好是现用现配，避免二次发酵引起全价料过酸。
