（1）坑埋法
把菜籽饼粕按1∶1比例加水，拌匀后按每立方米500～700kg埋于地下坑内，坑的大小可视原料多少而定。挖好坑后，坑底及四周用塑料膜铺好，然后将菜籽饼粕埋入坑内，上面用塑料膜盖好并封土20cm，经60天的自然发酵，脱毒率可达94%。地下水位低且气候干燥的地区较适宜。
（2）水浸洗法
把菜籽饼粕放在水缸里按饼粕重量的5倍加入清水，在36小时的浸泡过程中，换水5次，脱毒率可达90%。此方法简便易行，但水溶性营养物质损失较多。
（3）微生物脱毒法
用筛选出的菌株对菜籽饼进行固态发酵，脱毒率可达74%～100%。在工厂化条件下脱毒粕的硫氰酸脂和唑烷硫酮的总含量在0.75%以下，产品可以安全使用。并能改善饼粕的适口性。
（4）热喷脱毒法
将原料装入热喷罐内，密封后通入蒸汽，在约0.2MPa压力下，维持30分钟至1小时，再加空气至1MPa，骤然减压，经干燥后包装为成品，用热喷设备处理菜籽饼粕可以达到测不出毒素的效果，由于处理时间短，营养成分损失小，可改善饲料适口性，提高消化率。
（5）醇类水溶液处理法
醇类（多用乙醇和异丙醇）水溶液可提取出饼粕中的硫葡萄糖苷和多酚化合物，还能抑制饼粕中酶的活性。此法的缺点是耗用溶剂多，饼粕中醇溶性物质（如醇溶性蛋白质）损失较多。
（6）化学物质处理法
可采用碱、氨、硫酸亚铁
等处理。碱处理法可破坏硫葡萄糖苷和绝大部分芥子碱；氨处理法，同时进行加热，氨可与硫葡萄糖苷反应生成无毒的硫脲 ；硫酸亚铁处理法，铁离子可与硫葡萄糖苷及其降解产物分别生成螯合物，使其失去毒性。
