肝癌术后复发很常见，有数据统计，术后3年复发率约为40%-50%，术后5年的复发率则高达60%-70%。
一般认为肝癌复发分两种情况：
癌细胞残留
这是由于肝癌（特别是瘤体较大的肝癌）容易出现癌周组织侵犯和血管癌栓形成。因此，即使将肝癌瘤体完整切除或消融，但对已经进入小血管的癌细胞以及远离瘤体的微小癌灶，也难以发现和切除。这些癌细胞残留下来后可以继续生长。绝大多数肝癌复发都是癌细胞残留导致的。
实质新生的肿瘤
其发生机理与首次原发性肝癌相同，肝癌患者大部分都患有乙型肝炎，如果术后没有进行规范化抗病毒治疗，在患者免疫力低下时，病毒很容易再次破坏肝脏细胞，导致肝细胞恶变，进而肿瘤复发。
医生总结影响肝癌术后复发的因素可以归纳为9个：
①肿瘤大小：肿瘤的大小是影响复发的重要因素，此外肿瘤的数目也影响术后的肿瘤复发率。
②肿瘤的包膜：有人把肿瘤包膜是否完整作为肿瘤侵袭性的一个指标，但肝癌的包膜实际是由于肿瘤生长过程中对周围正常肝组织挤压形成的假包膜。在完整包膜外的肝组织中常可发现有癌肿浸润。近年来的文献也很少证明包膜的完整与否和术后复发有明确的关系，但是完整包膜的存在对根治性切除手术中切缘的确定有一定的意义。
③门静脉癌栓：肝内门静脉癌栓的存在是肝癌术后复发的另一个重要因素，易形成肝内转移灶。
④肿瘤的分化程度：恶性肿瘤的分化程度越低，侵袭性越大，因此分化程度低的原发性肝癌容易发生早期转移，从而导致切除不彻底，术后易复发。
⑤肝硬化程度：肝硬化影响复发的原因可能是限制了切缘的大小，从而降低了根治性切除率。此外肝硬化与肝癌的发生密切相关，可能是肝癌切除术后多中心复发的根源。
⑥肿瘤切缘：这是肝癌根治性切除标准中最重要的因素。切缘距肿瘤越远，镜下癌栓的检出率越低，术后复发率也越低。
⑦术中出血及输血量：术中的出血和输血量反映了手术创伤的程度，会影响肝癌的术后进程和免疫功能的恢复。
⑧术中对肿瘤的挤压：可能造成癌组织或肿瘤细胞的脱落，引发肝内转移或远处播散。成为术后复发的重要来源。
⑨肝炎状态：肝炎状态与肝癌术后复发存在密切关系。即导致实质新生肿瘤。
