有些人为什么有两本运动员证书（特级运动员证书有什么用）

这应该是两个不同级别的证书。如某一运动员经过不断努力训练，成绩提高，通过检测，由该项目的三级水平，达到了二级，取得证书。这样原有的三级和现在的二级就是两本。