第一段07:15-19:45
第二段05:45-22:00
班次间隔: 鱼珠-深井80分钟 ,新洲-深井30分钟 ,途径站点: 鱼珠-长洲 ,航线时间: 05:45-23:50(鱼珠) 05:45-24:00(长洲)
班次间隔: 高峰时段10分钟 (07:00-09:00/17:00-19:00)
夜班船(22:00以后)30分钟 ,其他时段15分钟, 新洲-深井30分钟 S12线路, 途径站点: 长洲-鱼珠-海心沙, 航线时间: 07:00/07:30/08:00由长洲往海心沙,
17:30/18:00/18:30由海心沙往长洲 , 班次间隔: 30分钟