一、幼树的整形修剪
枸杞树一般从定植到第三年为幼树期。幼树以整形为主，选留强壮枝条培养树冠骨架，逐步扩大树冠，增加结果枝。
第一年栽植后先定干，一般在离地面 60cm 处剪顶定干， 30cm 处以下侧枝剪除，并将上层所留主枝于 10 — 20cm 长处短截，以促使其发分枝，等主枝长出分枝后，在其两侧各选 1 — 2 个分枝作为一级大侧枝，并于约 10cm 处摘心、短截。
第二年培养树层，选树体主枝上发出的靠近中央的直立徒长枝约 30cm 处摘心，培养成中心干，待其发出分枝时，选留好的枝组摘心、短截，作为第二层主枝。
第三年树体冠形已基本形成，此时要进行疏枝，剪去过密枝和交叉枝，增强树体的通风透光能力。经过三年培养的树体可高达 1 米四五左右。
二、盛果期树的修剪
此时期树形已基本培养好，修剪的目的是调节生长与结果的关系，保持满园的丰产树形，使它持久丰产和稳产。按季节可将其分为春季修剪、夏季修剪、秋季修剪。
（一）春季修剪：主要是“剪干尖”，一般在 4 月中旬进行，主要任务是剪去越冬后干死的枝条或枝稍；同时也对季节修剪的不足之处进行补充修剪。
（二）夏季修剪：茨农称之为“抽油条”，一般在 5 月中上旬至 8 月上旬进行。其主要任务是对徒长枝（油条）的清除和利用。
一般生长在树冠上而树冠圆满又不必放顶，同时结果枝足够时，树冠上的徒长枝要清除；生长在根茎和主干上的徒长枝要清除。
树冠上的结果枝少时，要对徒长枝进行摘心或别枝处理；树冠高度不够时，对树顶上的徒长枝要进行摘心处理；偏冠树要用徒长枝纠正冠形；树冠缺空时，利用徒长枝摘心，短截后发侧枝补空；同时由于夏季气温适宜、肥水条件好，要勤抹芽、摘心、疏剪。
（三）秋季修剪：秋季修剪的原则是，打横不打顺，去旧要留新，密处来疏剪，缺空留“油条”，清膛截底修剪好，树冠圆满产量高。具体修剪方法和步骤如下：
1 、清基：主干基部萌蘖一些徒长枝，不需要利用的应首先把它剪掉。
2 、剪顶：剪去树冠顶上生长直立的徒长枝，保持树冠的一定高度。但对于高度不够的树冠，则利用这种徒长枝放顶，达到所需的高度。
3 、清膛：剪去树冠膛内的串条以及不结果或结果少的老弱枝，以便增强树冠的通风透光性。
4 、修围子：主要是剪除树冠周围的老弱枝、横条、摩条、病虫害枝以及过密枝，修剪后要求达到树冠枝条上下通顺，疏密分布均匀。
5 、截底：树冠围子修完后，有的枝条仍接近地面，影响田间管理和下年生长结果，应把接近地面的枝稍截去。
三、盛果后期树的修剪
盛果后期树的生长较弱，发枝较少，枝条短，产量显著下降。这时的修剪任务主要是增强树势，除进行盛果期树那样的一般修剪外，还要对衰弱的骨干枝或枝组进行更新复壮。具体方法是夏季利用徒长枝摘心，发出侧枝后培养成新的枝组，而把徒长枝以上的骨干枝回缩掉。如果无徒长枝，可在春季修剪时，回缩到 3 — 5 年生的骨干枝中部，甚至更重一些，促使剪口下方的隐芽萌发出徒长枝，再摘心利用。对主干及基部发出的无用徒长枝则应及时剪掉。
在更新复壮时，除修剪外，还应加强肥水供应和其他栽培管理，才会收到较好的效果。
