1、阴凉处储存
如果南瓜是完整的，还没有被切开，那么储存南瓜就容易多了，只需要将南瓜放置在阴凉处、通风口而且较为干燥的地方就可以将其保存很久。
2、冷藏冷冻储存
对于已经被切开的南瓜来说，可以先在南瓜切口表层覆盖一层保鲜膜，然后将裹有保鲜膜的南瓜放进冰箱的冷藏室里面进行保存。
3、堆藏
堆藏是把选好的南瓜直接堆放在室内。地面铺一层干草或麦秸，在上面堆放南瓜。摆放的方向要与生长时的状态相同，依次堆码成圆堆，每堆15-25个，高度5-6个瓜高为好。同时留出通道，以便检查。
储存方法：
1、堆藏 堆藏是把选好的南瓜直接堆放在室内。堆放前地面先铺一层干草或麦秸，上面堆放南瓜。摆放的方向和生长时的状态相同，可将瓜蒂朝里，瓜顶朝外，依次堆码成圆堆，每堆15-25个，高度5-6个瓜高为好。同时留出通道，以便检查。
2、窖藏 窖藏的南瓜宜选用主蔓上第二个瓜，根瓜不宜作贮藏用。生育期间最好不使瓜直接着地，并要防止阳光暴晒。采收时谨防机械损伤，特别要禁止滚动、抛掷，否则内瓤震动受伤易导致腐烂。南瓜采收后宜在24℃-27℃下放置2周，使瓜皮硬化有利于贮藏，这对成熟度较差的瓜尤为重要。
3、架藏 架藏的仓位选择、质量挑选、降温、防寒和通风等要求与堆藏相同。所不同的是仓库内用木、竹或角铁搭成分层贮藏架，铺上草包，将瓜堆放在架上。或用板条箱垫一层麦秸作为容器。瓜放入后码成垛进行贮藏。这种方法透风散热效果比堆藏好，仓位容量也比堆藏大，观测、检查比较方便。
