1.科属不同
孜然，又名:枯茗、孜然芹，在南疆则被称为小茴香。属伞形目，伞形科，孜然芹属一年生或二年生草本。
茴香，又叫怀香，怀香籽，香丝菜，茴香子，谷香，属伞形目，伞形科，茴香属多年生草本。
千里香，又称:七里香，万里香，九秋香，九树香，过山香，黄金桂，青木香，月橘。为芸香科，九里香属小乔木或灌木。
2.形态特征不同
孜然，高20-40厘米，全株（除果实外）光滑无毛。叶柄长1-2厘米或近无柄，有狭披针形的鞘；叶片三出式2回羽状全裂，末回裂片狭线形；花瓣粉红或白色，长圆形，顶端微缺，有内折的小舌片；萼齿钻形，长超过花柱；花柱基圆锥状，花柱短，叉开，柱头头状，分生果长圆形，两端狭窄，密被白色刚毛；每棱槽内油管1，合生面油管2，胚乳腹面微凹。花期4月，果期5月。
茴香，草本，高0.4-2米。茎直立，光滑，灰绿色或苍白色，多分枝。较下部的茎生叶柄长5-15厘米，中部或上部的叶柄部分或全部成鞘状，叶鞘边缘膜质;叶片轮廓为阔三角形；复伞形花序顶生与侧生；花黄色，倒卵形或近倒卵圆形；果实长圆形，5条隆起的棱，尖锐;每个棱槽内有油管1，合生面油管2;胚乳腹面近平直或微凹。花期5-7月，果期7-10月。
千里香，小乔木，高达12m。树干及小枝白灰或淡黄灰色，略有光泽，当年生枝绿色，其横切面呈钝三角形，底边近圆弧形。花序腋生及顶生，通常有花10朵以内，稀多达50余朵;萼片卵形，花丝白色，线状，比花柱略短，药隔中央及顶端极少有油点;花柱绿色，细长，果橙黄至朱红色，狭长椭圆形，稀卵形，顶部渐狭，有甚多干后凸起但中央窝点状下陷的油点，种子1~2粒;种皮有棉质毛。花期4~9月，也有秋、冬开花，果期9~12月。
