农村在自己院子建库房属于哪个部门管（农村自建房施工队归什么部门管理）

按照农村建房程序办理，属于乡镇人民政府管辖，向乡镇农业农村部门申请。

一般农村村民建住宅应按申请、审核、现场查勘、发放许可证、验收、确权办证等程序办理，未经审批擅自建住宅或其他建筑物属违法建筑，应予拆除。如果您的车库建设超过了宅基地的范畴，或者进行商业用途，或者在住宅下方建设车库(也就是将车库作为一楼)层数过高的话，还需要考虑房子的层数是否符合当地的标准，一般农村村民住宅建设最多为三层以下（含三层）。