不论是两冲程还是四冲程，都有汽油机和柴油机两种，它的整体结构可以分为两大机构、五大系统，即曲柄连杆机构，配气机构、燃料供给系、润滑系、冷却系、点火系和起动系。汽油机和柴油机最大的区别是柴油机没有点火系，而且二者的燃油供给系也有很大的区别；从热效率方面来说，柴油发动机更高一些。为了更好的说明这两种发动机的区别，我将这些机构和系统分别说说。
1、曲柄连杆机构
曲柄连杆机构是发动机实现3工作循环，完成能量转换的主要运动零件。它由机体组、活塞连杆组和曲轴飞轮组等组成。两冲程发动机与四冲程发动机的活塞连杆组和曲轴飞轮组结构基本上是一样的，区别在于机体组。
发动机的机体组可以分为气缸盖和气缸体两部分。对于四冲程发动机来说，它的气缸盖结构是非常复杂的，上面有进排气门、冷却水道、机油通道等；它的气缸体结构相对简单，一般只是一个密闭的圆筒而已。
而两冲程发动机恰恰与此相反，它的气缸盖结构是比较简单的，一般只是一个简单的盖子而已，即使有气门，也只有一个排气门；而气缸体却是比较复杂的，在气缸壁上开有进气口和排气口。
2、配气机构
配气机构的功用是根据发动机的工作顺序和工作过程，定时开启和关闭进气门和排气门，使可燃混合气或空气进入气缸，并使废气从气缸内排出，实现换气过程。对于四冲程发动机来说，它的配气机构是极为复杂的，主要由凸轮轴、气门、气门挺杆等组成。特别是现在的发动机，越来越多的使用单缸四气门和可变气门正时技术，使配气机构称为了发动机中最为复杂的机构。
而对于两冲程发动机来说，它的配气机构就简单多了，甚至严格来说，它是没有配气机构的。它的进排气是通过曲轴运转、活塞上下运动，打开和关闭位于气缸壁上的进气口和排气口来实现的。在两冲程柴油机上一般有一个排气门，不过结构上比四冲程柴油机要简单得多。
3、燃油供给系统
燃料供给系的功用是根据发动机的要求，配制出一定数量和浓度的混合气，供入气缸，并将燃烧后的废气从气缸内排出到大气中去。现在四冲程发动机的燃油供给系统越来越复杂了，一般都采用多点电喷或缸内直喷，或者混合喷射，在结构上有汽油泵、喷油器、油压调节机构等。而两冲程发动机的燃油供给系统是比较简单的，仍然以化油器式居多，使用电喷的很少，结构上也要简单很多。
4、润滑系统
润滑系的功用是向作相对运动的零件表面输送定量的清洁润滑油，以实现液体摩擦，减小摩擦阻力，减轻机
